非变性质谱在ADC及单抗糖基化分析中的应用
非变性质谱即天然质谱法(Native Mass Spectrometry),是一种用于分析蛋白结 构的质谱方法。使用这种方法,不改变蛋白 结构,因此可获得分析物在天然状态下 的结构信息[1] ,这是Native MS的在蛋白药物分 析中的个重要特性:非变性分析特性。 之所以可以保持蛋白的天然结构,一方面是 因为在Native MS分析中,避免了乙腈等有机 溶剂的使用,而是采用乙酸铵中性缓冲溶液; 另一方面,在离子化时,为了避免了高温及 高电压条件,而采用了如纳升静态喷雾等柔 和的离子化方式[2] 。
相对于常见的变性质谱法,在Native MS 的原始质谱数据中,蛋白的离子信号移动到 了更高的质荷比区域。这是由于在常见的全 蛋白分子量测定中(变性质谱法),蛋白在 含有乙腈的缓冲液及高温高电压的离子化条 件下,其结构被破坏,而伸展开来,暴 露出了更多的可结合H+的部分,因此携带了更 多的电荷。对于单抗来说,采用变性质谱法,其质荷比主要分布于2000m/z至4000m/z,而 Native MS 条件下 , 则分布于 5000m/z 至 7000m/z区域(图1)。从图一可以看出,在 Native MS图谱中,不但信号的分布区域位于 高质荷比区,更重要的是,由于所带电荷数 减少,信号分布变得疏离。在复杂样本分析 时,疏离的信号分布会降低信号相互覆盖的 可能性。这是Native MS在蛋白药物分析中的 第二个重要特性:简化图谱特性。
在单抗药物相关分析中,Native MS的非 变性分析特性,被用于Cystine Linked ADC(利 用还原二硫键形成的抗体-药物偶联物)以及 抗体-抗原结合等分析;而Native MS的简化图 谱特性则被可用于糖基化定量、双功能抗体、 混合抗体等分析项目中。
由于Native MS中样品的质荷比远远高于 常见的质谱信号,因此要对质谱硬件进行特 殊设计。问世的Exative Plus EMRTM质谱, 是以超高分辨质量分析器Orbitrap(静电场轨道阱)为基础的,专为Native MS分析需求所设计 的一款仪器 , 其质荷比范围可覆盖至 20000m/z。Exative Plus EMR以其超高分辨率、 信号基线分辨能力以及*的稳定性,不但 被广泛应用在蛋白药物分析,甚至在分子量 高达80万Da的蛋白复合体分析中都已被采用[3] (图2)。
除高质荷比范围采集能力外,去除粘附在 蛋白上的溶液分子及金属离子也是提高Native MS图谱质量的必要条件。粘附分子或离子的 存在会造成蛋白质量变大的假象 [4] (图3), 从而影响分析准确度。Exative Plus EMR在离子 源以及HCD碰撞池,为去除粘附分子及离子做 了*的专门化设计[3] 。不同于其他的高分辨 质谱,Exactive Plus EMR允许用户设置一定的 HCD碎裂能量以去除粘附分子及离子;同时, *的EMR mode具有Automatically HCD GasControl 功能,可对HCD碰撞池中的N2气压进 行调节。在Exactive Plus EMR上通过协同优化 源内裂解能量 、 HCD 碎裂能量和 HCD gas control三个参数,可尽可能多地除去粘附分子 及离子。
随着单抗药物市场竞争及应对抗体抗药性 的需求,单抗-药物偶联物(Antibody Drug Conjugate,ADC)类药物已经成为新型抗体药 物开发的一个重要方向。在各种ADC药物中, 通过还原单抗二硫键,将小分子药物连接到 半胱氨酸巯上而形成的Cystine Linked ADC药物, 由于其较好的结构均一性及更稳定的化学连 接形式,已经成为ADC药物开发的重要方向。 但是,由于负责连接轻、重链的二硫键被打 开,单抗内各链间依靠非共价结合,因此, 此类ADC药物的结构稳定性差。如果采用 常规的质谱方法分析其DAR值(Drug Antibody Ratio),各链会发生分离,导致分析失败。 而Native MS的非变性分析特性,正适用于此。 图4为Cystine Linked ADC药物Adcetris进行DAR 分析的原始质谱数据(Adcetris是FDA于2011 年批准的用于治疗霍奇金淋巴瘤以及复发性 间变性大细胞淋巴瘤ADC药物)[4] 。图中分别 展示了去糖基化与保留糖基化非变性质谱数 据,可以看到,即使是在样品复杂程度巨大的含糖链ADC药物的图谱,含相同小分子药结 合数量的单抗信号也都被清晰分辨,这就为 DAR值的准确计算打下了坚实的基础。
Native MS在单抗寡糖的含量测定分析中 具有*的角度与优点(图5)。在常见的分 析方法中,首先是将糖链通过糖苷酶将寡糖 从蛋白中释放出来。被释放的寡糖将通过多 步处理,使其连接荧光基团。荧光基团的加 入是因为寡糖本身无光谱吸收,且离子化效 率非常低,不利于质谱分析。标记荧光基团 后,可使用荧光检测器分析,并提高其质谱 分析的离子化效率。但是荧光标记必须经过 多步复杂的样品处理操作,整个实验时间也 需要约2天时间。因此此种方法具有工作效率低,实验成本高,操作难度大等缺点。如果 操作经验不足,易造成重现性差等问题。特 别是对于含有唾液酸的寡糖,在样品处理时 容易丢失,造成实验分析失败。此外,在连 接了荧光基团的寡糖中,荧光基团只占了非 常小的一部分,对其寡糖离子化效率的提升 有限。这也是寡糖在进行液质分析时,采用 液相-荧光检测-质谱检测的原因(荧光信号主 要负责定量,质谱信号主要负责定性)。既 然荧光标记法具有如此多的不足之处,为何 其在单抗的寡糖分析中仍被广泛应用?归根 结底,无非是因为想克服寡糖检测信号的问 题。而单抗上的寡糖其实天然地携带了一个 可提升信号的标记基团——抗体肽链部分。抗 体分子量近15万Da,而糖链分子量仅为3-4千
Da左右。因此在质谱分析的离子化过程中, 单抗的肽链将起到决定性作用。Rosati等的研 究,有力的证明了这一点:唾液酸含量是寡 糖离子化大的影响因素,唾液酸越多,寡 糖离子化越差,因此会造成不同组成糖链的 离子化效率不同,从而造成巨大的寡糖定量 分析误差。Rosati等发现,对于单抗,采用 Native MS分析,在去除唾液酸前后,其定量 结果相同[4] 。这就证明,在Native MS条件下, 唾液酸对单抗离子化效率没有影响, 可以得 到更为准确的定量结果。除避免了由于离子 化效率的影响, Native MS不需要复杂的实验 操作,从而巨大地提高了实验的重现性和准 确度。此外,整个实验时间也大幅缩短,大 大提高了工作效率。在应用Native MS对单抗 寡糖准确定量的背后,包含了Native MS的简化图谱特点:Native MS疏离的信号分布会降 低不同糖型信号间相互覆盖的可能性,高质 量的原始质谱数,是寡糖准确定性与定量的 保证。类似的应用还有难度更大的混合抗体 分析等[5] 。在Natalie等人的工作中,采用以 Orbitrap为基础的Native MS分析15个单抗混合 物,并对其进行定量分析,大定量分析误 差(标准差)仅为1.14%[5]
借用生物质谱人Heck在2012年Nature Methods上的一段话作为结尾“我们相信,以 Orbitrap质谱分析器为基础的非变性质谱法, 将会对结构生物学、生物化学、系统生物学、 蛋白相互作用网络研究,特别是生物药物表 征分析等多个领域产生巨大的影响”[3] 。
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